内蒙古农业大学学报编辑部现为学校直接领导的二级教学科研机构，编辑部下设3个编辑室，即社会科学版编辑室、自然科学版编辑室和蒙古文综合版编辑室。现有教职工10人。
2002年创办《内蒙古农业大学学报》（蒙古文综合版），目前在内蒙古自治区内部交流发行，准印号为内蒙古自治区内部资料15-031/C。《内蒙古农业大学学报》创刊于1957年，当时刊名为《内蒙古畜牧兽医学院院刊》，这是内蒙古高校创办最早的学报，也是内蒙古创办最早的科技期刊之一。1999年，原内蒙古农牧学院和原内蒙古林学院合并成立新的多科性大学—内蒙古农业大学，学报更名为《内蒙古农业大学学报》，分自然科学版和社会科学版两种版本发行。《内蒙古农业大学学报》（自然科学版）国内统一刊号为CN15-1209/S，国际标准刊号为ISSN 1009-3575；《内蒙古农业大学学报》（社会科学版）国内统一刊号：CN15-1207/G，国际标准刊号：ISSN1009-4458。
